Cele mai faimoase companii aeriene din Ecuador sunt LAN Ecuador şi AeroGal. Ambele linii oferă atât zboruri interne, cât şi zboruri internaţionale. LAN Ecuador este o filială a uneia dintre cele mai mari companii aeriene din America de Sud - LAN. Trasnsportatorul oferă conexiuni către Argentina, Chile, Peru şi Statele Unite ale Americii. Către Europa operează pe o singură destinaţie în Madrid, Spania. AeroGal este o companie aeriană din Ecuador ce şi-a început operaţiunile cu zboruri de exploatare către Insulele Galapagos, iar acum în lista de destinaţii se mai găsesc Columbia şi Statele Unite ale Americii.
